Tutto comincia in un laboratorio dove viene creato, a partire dal DNA di Mew, il primo pokémon geneticamente modificato, Mewtwo, il quale distrugge il laboratorio grazie ai propri poteri psichici. Ash, Brock e Misty nel frattempo organizzano una gara, invitando alcuni tra gli allenatori più importanti e bravi in assoluto, per mettere in mostra ed allenare i propri pokémon. Durante i combattimenti giunge sul luogo Mew, che ingaggia una battaglia con Mewtwo. Ash tenterà ad ogni modo di fermare questo combattimento tra i due, e muorirà colpito ad un braccio. Le lacrime dei pokémon però lo riporteranno in vita, e dimostreranno a Mewtwo che non tutti gli umani sono malvagi.

Trailer di Pokémon Mew contro Mewtwo